在一些肿瘤细胞中缺少端粒酶逆转录酶（TERT）会导致端粒酶的失活，说明TERT 的量和端粒酶活性存在平行关系，与此相似，端粒酶RNA组分（TERC）的量与端粒酶活性也有平行关系。
TERC的转录会被 Sp1 和 HIF-1 激活而被 Sp3 抑制，这在MAPK 的信号级联通路与 TERC 启动子的沉默中都能找到依据 。
而且，TERT 和 TERC 的转录似乎会受到表观遗传控制，如 H3 和 H4 乙酰化水平降低会抑制 TERC 的表达。
TERC 中至少有 6 个位点会受到假尿苷化修饰，有趣的是，这些位点中的两个都位于一个对端粒酶催化活性非常重要的高度保守结构域。
利用假尿苷化 TERC 所做的端粒酶体外重构实验表明在假尿苷化后端粒酶的活性和持续合成端粒能力都发生改变，这进一步说明在体内，TERC 的修饰可能会调控端粒酶活性，但是这还需要确切的证据来证明 。
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