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染菌原因分析
（一）染菌的杂菌种类分析
对于每一个发酵过程而言，污染的杂菌种类的影响是不同的。如在抗生素的发酵过程中，青霉素的发酵污染细短产气杆菌比粗大杆菌的危害更大；链霉素的发酵污染细短杆菌、假单胞杆菌和产气杆菌比污染粗大杆菌更有危害；四环素的发酵过程zui怕污染双球菌、芽孢杆菌和夹膜杆菌；柠檬酸的发酵zui怕青霉菌的污染；谷氨酸发酵zui怕噬菌体污染。因噬菌体蔓延迅速，难以防治，容易造成连续污染。若污染的杂菌是耐热的芽孢杆菌，可能是由于培养基或设备灭菌不*、设备存在死角等引起；若污染的是球菌、无芽孢杆菌等不耐热菌，可能是由于种子带菌、空气过滤效率低、除菌不*、设备渗漏和操作问题等引起涸
 
污染的是真菌，就可能是由于设备或冷却盘管的渗漏、无菌室灭菌不*或无菌操作不理当、糖液灭菌不*(特别糖液放置时间较长)而引起。
 
(二)发酵染菌的规模分析
从染菌的规模来看，主要有三种。 
①大批量发酵罐染菌。如发生在发酵前期，可是种子带菌或连消设备引起染菌；如果染菌发生在发酵中期、后期，且这些杂菌类型相同，则一般是空气净化系统存在诸如空气系统结构不合理、空气过滤器介质失效等问题。
 ②部分发酵罐染菌。如果染菌发生在发酵前期，就可能是种子染菌、连消系统灭菌不*；如果是发酵后期染菌，则可能是中间补料染菌，如补料液带菌、补料管渗漏。
 ③个别发酵罐连续染菌(此时如果采用间歇灭菌工艺，一般不会发生连续染菌)。个别发酵罐连续染菌，大都是由于设备渗漏造成，应仔细检查阀门、罐体，或罐器是否清洁等。一般设备渗漏引起的染菌，会出现每批染菌时间向前推移的现象。
 
(三)不同污染时间分析
从发生染菌的时间来分析，也是三种情况。
①染菌发生在种子培养阶段，或称种子培养基染菌。此时通常是由种子带菌、培养基或设备灭菌不*，以及接种操作不当或设备因素等原因而引起染菌。
②在发酵过程的初始阶段发生染菌，或称发酵前期染菌。此时大部分染菌也是由种子带菌、培养基或设备灭菌不*，以及接种操作不当或设备因素、无菌空气带菌等原因而引起。
③发酵后期染菌大部分是由空气过滤不*、中间补料染菌、设备渗漏、泡沫顶盖以及操作问题而引起染菌。